薬剤治療なら、一日に二回、薬剤を飲ませることになる。これまでの症例で、薬剤投与により、数年程度余命が延びることも少なくない。また、この病気で、心臓の筋肉が肥大する、肥大型心筋症と同様の症状（心臓内に血液があまり入らず、心臓は全身に血液を送ろうと心拍数を上げ、脈が速くなって呼吸も荒くなる）になっても、薬剤を投与すれば症状が収まってきたりする（普通の「肥大型心筋症」の場合、原因不明で、症状はコントロールできるが、根治療法はない）。
　しかし、長期投与すれば副作用の問題もある。また、薬でうまく甲状腺ホルモンの分泌量をコントロールできても、症状が悪化するケースがある。

　より効果的なのは、甲状腺を切除する外科療法である。最初に薬剤を投与して症状を安定させ、体調や内臓の様子をチェックしてから手術を行う。適切に甲状腺を切除すれば、ホルモン分泌がやみ、症状が改善され、寿命が延びることが多い（南が丘動物病院での症例で、手術後八年間生存した猫もいる）。しかし、こちらの方もいくつか問題が潜んでいる。
　その一つは、甲状腺を切除すれば、腎機能が一挙に低下して腎不全を起こす猫もいるため、最初に薬剤投与を行って腎機能の状況を調べ、手術すべきかどうかを判断する。
　二つ目は、甲状腺に付随する「上皮小体」という小さな組織にかかわる問題だ。上皮小体はカルシウムの産生や吸収をコントロールしている重要な組織だ。手術時、もし、それを傷つけるか、切除してしまった場合、体内のカルシウムが減少する「低カルシウム血症」を起こし、一命にかかわる事態になりかねない。そこで、左右二つある甲状腺を片方ずつ切除して、危険性を減らすことも多い。また、事前に上皮小体だけを切除して、首周辺の筋肉組織に埋め込む方法もある。数週間すれば、移植された上皮小体が機能し始める。
　甲状腺を取り除いたあとは、わずかに残る組織片や外部甲状腺細胞塊（舌根から心臓基部にかけて存在）が脳下垂体から分泌される甲状腺刺激ホルモンの影響で反応し、甲状腺ホルモンを分泌するケースがほとんど（約98パーセント）である。したがって、手術後に甲状腺ホルモン剤を投与する必要はない。
　なお、アメリカでは、放射性ヨードを投与して、異常を起こした甲状腺を内科的に破壊する療法が注目されている。ただし、放射性物質を使うため、日本では認可されていない。