原因不明の「特発性」の場合
　動物の体は、“免疫”という、体内に侵入するウイルスや細菌などの外敵を識別し、攻撃するシステムで守られている。だから、もし、血管内に入った病原体が赤血球に感染すると、それを感知した免疫システムが赤血球ごと退治してしまう。
　ところが、犬によっては、その体質により、明らかな原因がないにもかかわらず、免疫システムが自己の赤血球を“外敵”と見なして攻撃し、次々に破壊して貧血に陥るケースがある。それを特発性の免疫介在性溶血性貧血という。

何らかの原因がある「続発性」の場合
　それに対して、何らかの原因が引き金になって犬の免疫システムが働き、血管内の赤血球を破壊することによって起こる貧血を、続発性の免疫介在性溶血性貧血という。
　原因として、ウイルス感染やワクチン接種などが考えられる。まず、犬の血管内に入ったウイルスが赤血球に感染し、増殖して、次々に新たな赤血球への感染と増殖を繰り返す。すると、外敵侵入を感知した免疫システムがウイルスに感染した赤血球を識別して、破壊していく。感染した赤血球の数が多ければ、破壊される赤血球の数も増え、犬は貧血状態になる。
　なお、ワクチン接種も、いわば弱毒化、あるいは無害化したウイルス感染によって、体の免疫システムにそのウイルスの識別・攻撃態勢を準備させるものである。だから、ワクチン接種によって免疫システムの働きが活発化し、わずかに感染した赤血球を攻撃するケースも起こりうる。

　野山や公園などの草むらに潜み、通りかかった動物の体に飛びついて吸血するマダニの中には、「バベシア」という原虫が寄生していることがある。
　そんなマダニが犬に取りつき、吸血すると、バベシアが犬の血管内に侵入して赤血球に感染。増殖しては赤血球への感染を繰り返す。すると、免疫システムが感知して、バベシアに感染した赤血球を攻撃し、犬は溶血性貧血に陥ってしまう。もし、新たなマダニがバベシアに感染した犬の血を吸えば、バベシアはそのマダニの体内に寄生し、感染の輪を広げていく。
　バベシアに感染したマダニは、中国地方や四国、近畿地方の野山に多く生息していることが知られているが、近年は、東海から関東地方へも感染による被害が広がり始めている。

　犬がタマネギやネギ、ニンニクなどを含む人間の食べ物を食べると、それらの植物のある成分の酸化作用によって赤血球が変形しやすくなる。そのような変形した赤血球が脾臓で破壊され、溶血性貧血を起こす。